膜蛋白抗体开发攻略:Nanodisc技术助力GPCR、离子通道免疫与筛选

在当前药物研发版图中,膜蛋白靶点始终占据核心位置。无论是G蛋白偶联受体(GPCR)离子通道,还是转运蛋白,它们与信号转导、细胞通讯和疾病发生机制联系紧密。据统计,超过60%的已上市小分子药物靶向膜蛋白,但在抗体药物领域,膜蛋白由于其高度疏水、结构复杂、天然构象依赖脂质环境等特性,一直被视为“难以对付的靶点”。膜蛋白一旦脱离膜环境,往往会出现构象塌陷、表位丢失或功能失活。这直接影响抗体研发中的两个关键环节:免疫阶段与筛选阶段。为了解决膜蛋白表达的问题,研究者们开发了Nanodisc制备技术,这一技术也逐渐成为膜蛋白抗体开发的重要工具,并在近年来的多项研究中展现出可复制的应用价值。

1、Nanodisc技术简介

Nanodisc指的是一类用于稳定和呈现膜蛋白的仿生脂质颗粒体系。其共同特征在于:通过不同类型的膜稳定剂或支架分子,在水相环境中为膜蛋白构建一个尺度可控、成分可定义的脂质双层微环境,从而最大程度保留膜蛋白的天然构象和功能状态。随着技术的发展,Nanodisc 体系已经从早期的膜支架蛋白(MSP)依赖型结构,逐步扩展到多种不同的膜稳定策略。更多关于Nanodisc的分类与特性,请阅读>>

正是这种功能统一、实现路径多样的特性,使Nanodisc成为当前膜蛋白研究与抗体开发中广泛采用的通用解决方案,而非单一技术路线。与传统的去垢剂溶液或膜片段相比,Nanodisc 的核心优势在于:既保持膜蛋白在膜中,又具备可操作性。这使其在结构生物学、药物筛选,以及近年来的抗体免疫与筛选中被越来越多地采用。但Nanodisc是否真的能够在抗体研发中发挥决定性作用?一个来自GPCR单域抗体研究的真实案例,给出了清晰答案。

2、APJ-Nanodisc如何推动单域抗体JN241-9的发现?

在一项发表于Science Advances的研究中,研究团队聚焦于Apelin receptor(APJ),一种典型的A类GPCR。尽管该APJ在心血管和代谢疾病中具有重要治疗潜力,但其抗体开发长期受限于构象不稳定、功能表位难以保持等问题。在这项研究中,APJ-Nanodisc被分别用于免疫原免疫和噬菌体展示筛选。

2.1 APJ-Nanodisc作为免疫原

研究者首先将热稳定化的人源APJ膜蛋白重构到Nanodisc中,形成APJ-Nanodisc复合物。随后,他们直接使用这一复合物免疫羊驼,构建单域抗体(VHH)文库。这一策略的关键意义在于:

  • 免疫系统接触到的是嵌于脂质环境中的完整GPCR构象
  • 多跨膜区及构象依赖型表位得以保留
  • 避免了仅针对胞外片段或非天然折叠区域产生抗体

换句话说,Nanodisc在免疫阶段就已经显著提高了获得功能性抗体的起点概率。

2.2APJ-Nanodisc,用于噬菌体展示筛选

更值得注意的是,研究中并未在筛选阶段“更换抗原形式”。在后续的噬菌体展示筛选中,APJ-Nanodisc再次被用作抗原,用于富集高亲和力、构象敏感型的抗体克隆。这种免疫即筛选抗原的一致性设计,使得:

  • 免疫产生的抗体与筛选靶标高度匹配
  • 筛选偏向于真正识别天然APJ构象的抗体
  • 大幅减少免疫有效、筛选失效的情况

最终,研究者获得了多个APJ结合的单域抗体,并在此基础上结合结构解析与理性设计,开发出具有激动剂活性的候选分子JN241-9。这一案例清晰展示了Nanodisc并非仅是一个载体,而是贯穿免疫与筛选全流程的核心技术组件[1]

3、Nanodisc在膜蛋白抗体开发中的核心价值总结

结合该文献及近年来的研究实践,Nanodisc在膜蛋白抗体开发中主要体现出以下几方面作用:

01  保留天然构象,提高功能性抗体比例

Nanodisc里的膜稳定剂,有助于维持GPCR、离子通道等膜蛋白的构象完整性,使抗体更可能识别真实药理相关表位。

02  同时适用于免疫与筛选,流程高度一致

避免免疫抗原与筛选抗原不一致导致的“假阳性”或功能缺失问题。

03  特别适配单域抗体、纳米抗体开发

VHH对构象高度敏感,Nanodisc与驼类免疫体系具有天然协同优势。

04  对复杂靶点(GPCR /多跨膜蛋白)尤为友好

相比胞外片段蛋白,Nanodisc更适合难靶点[2][3][4]

随着Nanodisc技术在膜蛋白抗体开发中的应用逐渐成熟,一个更现实的问题也随之浮现:在具体项目中,是否应该优先选择Nanodisc作为免疫原?

4、Nanodisc vs多片段蛋白:膜蛋白抗体开发中的两种免疫原策略

在多数研发实践中,多片段蛋白(更多关于多片段蛋白在治疗性抗体开发中的应用>>)仍然是被广泛采用的传统方案。与Nanodisc相比,这两种免疫原形式各自解决的问题并不完全相同。理解它们的差异,有助于在不同阶段为膜蛋白抗体项目选择更合适的起点[5]

在实际抗体研发项目中,免疫原策略的选择应服务于最终研发目标。当靶点构象复杂、功能依赖跨膜区协同变化,或目标是获得具有调节活性的治疗性抗体时,Nanodisc往往具备更高的长期成功率;而在项目早期需要快速获取抗体资源、验证靶点可行性或进行表位探索时,多片段蛋白依然是高效且实用的选择。

 

参考文献:

  • Ma Y, et al. Structure-guided discovery of a single-domain antibody agonist against the apelin receptor. Science Advances. 2020.
  • Kijimoto-Ochiai S, et al. Nanodisc-based immunization strategies for membrane protein antibody discovery. Front Immunol. 2021.
  • Hino T, et al. Antibody-based GPCR modulation: structural insights and therapeutic potential. Nat Struct Mol Biol. 2019.
  • Manglik A, et al. Structural insights into GPCR signaling using nanodisc technology. Nature. 2015.
  • Lee SC, et al. Strategies for antibody discovery against challenging membrane proteins. mAbs. 2021.

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